Ich mache auf meinen Servern und Zuhause auf den Kisten zu 98% mit docker-compose - es ist im ersten Moment ein wenig mehr Arbeit, aber im Endeffekt weiss ich so, wo Daten usw wirklich abgelegt werden.
Ich nutze auch fast keine Docker-Daten-Volumes, sondern verlinke (bind) sie irgendwo ins HomeVerzeichnis